曾用刊名：《上海科技大学学报》与《上海工业大学学报》合并
《上海大学学报（自然科学版）》是由上海市教育委员会主管、上海大学主办的综合性自然科学学术期刊（双月刊），创刊于1995年。名誉主编周邦新院士，主编孙晋良院士。本刊以高校师生、科研人员、工程技术人员及其他有关人员为读者对象，主要刊登基础科学、技术科学和应用科学领域的研究成果（国家自然科学基金、863高科技项目等产出论文）。
本刊入选国家科技部“中国科技核心期刊”、国家新闻出版总署“中国期刊方阵”、《中文核心期刊要目总览》（2017年版）。同时，刊物被美国EBSCO学术数据库、美国《数学评论》（MR）、《化学文摘》（CA）、《剑桥科学文摘》（CSA）、德国《数学文摘》（ZM）、中国期刊全文数据库、中国学术期刊综合评价数据库、中国核心期刊（遴选）数据库、中国科学引文数据库、中国学术期刊（光盘版）数据库、万方数据系统科技期刊群数据库等十余种国内外检索性文摘和数据库收录。
作为一本代表上海大学学术水平和有利于扩大学校声誉的学术类期刊，本刊坚持将品牌化、特色化作为工作重点。严格执行三审制，即坚持编辑部初审、外审专家双向匿名审稿、主编终审，外审专家审稿环节上，坚持公正、公平的原则，确保审稿的公正性、严肃性和审稿的质量，以此保证学报的学术质量。
本刊坚持将品牌化、特色化作为工作重点，主要表现在：
(1)内容创新：推出学科专辑，不断探索综合性期刊专业化道路；
(2)栏目创新：推出“重点实验室”等专栏，打造精品栏目；
(3)信息化创新：建立编辑与作者、读者网上交流论坛；
(4)活动创新：打造“上大期刊屋”服务平台。
本刊编辑部重视编校质量，采取精心编稿、多遍校对等措施，力求把编校差错率降到最低。近年来本刊共获得以下奖项：
2006年获市科技期刊编校质量审读评比第一名
2008年获第二届中国高校优秀科技期刊奖
2009年获全国高校科技期刊优秀编辑质量奖
2010年获第三届中国高校优秀科技期刊奖
2011年获上海市科技期刊审读优秀奖
2011年获上海市期刊编校质量优秀奖
2012年获第五届华东地区优秀期刊奖
2012年获第四届中国高校优秀科技期刊奖
2012年获上海市期刊编校质量优秀奖
2013年获上海市期刊编校质量优秀奖
2014年获第五届中国高校优秀科技期刊奖
2016年获中国高校优秀科技期刊奖
2016年获上海市高校优秀科技期刊奖
2017年获全国“百强科技期刊”奖
2018年获中国高校百佳科技期刊奖
2018年获第三届上海市高校精品科技期刊奖